Résumé

Dans le contexte de la pandémie de SARS-CoV-2, l'OMS a renouvelé en 2022 sa liste de pathogènes prioritaires en y faisant figurer la Maladie X, causée par “un agent pathogène inconnu susceptible de provoquer une grave épidémie internationale”. L'OMS incite ainsi la communauté internationale à élargir la recherche aux pathogènes encore inconnus, afin de se préparer à la prochaine pandémie, qui sera probablement causée par un nouveau virus respiratoire. Pour ce faire, il est nécessaire de développer rapidement des modèles innovants et des protocoles de recherche déployables dès le début d'une telle épidémie, afin d'informer en temps réel toutes les autorités et acteurs de la santé, au moyen d'analyses, de prévisions précoces et de projections robustes.

Le projet PReViX, financé à hauteur d’1,4M€ par le PEPR MIE, a pour ambition de développer un cadre scientifique et sanitaire opérationnel pour les virus respiratoires, qui répondra à l’incitation de l’OMS. Il tire parti du corpus scientifique et de l'expérience acquise au fil des épidémies et des pandémies de grippe et de coronavirus des deux dernières décennies. Chacun de ses six axes utilisera des approches adaptées aux défis à venir, relevant de la diversité des sources de données, de l’analyse en temps réel de ces dernières, ainsi que de l'aide à la décision sanitaire de crise. Ces travaux permettront d'établir les contours microbiologiques, infectiologiques et épidémiologiques des futures menaces virologiques respiratoires, tout en développant des méthodes innovantes pour surveiller, caractériser, modéliser en temps réel et freiner la propagation précoce d'un virus respiratoire (ré-)émergent, à partir des premières données disponibles, hétérogènes tant en nature qu’en qualité.

Les principaux défis sont les suivants :

1) l'évaluation précoce du potentiel pandémique et de crise sanitaire du virus respiratoire;

2) l'utilisation des dynamiques intra-hôte virales et immunologiques pour mieux cibler les politiques de dépistage et de vaccination;

3) le développement d’outils d’analyses de séquences génomiques virales plus performants et plus accessibles;

4) une meilleure caractérisation de la dynamique des anticorps et l'amélioration des prévisions épidémiques à partir des données antigéniques;

5) la conception de stratégies précoces d’interventions non pharmaceutiques et

6) d’adaptation rapide du système de santé à l’épidémie du virus respiratoire, en fonction des caractéristiques de ce dernier.

Ce projet est mené par un consortium national de 11 structures de recherche réparties sur 4 sites, dotées d'une expertise interdisciplinaire couvrant les domaines de l'épidémiologie et de la modélisation des maladies infectieuses, de la santé publique, de la phylogénomique, de la virologie, de l'infectiologie, des sciences comportementales et sociales, et ayant produit plusieurs résultats majeurs pendant la pandémie de COVID-19. En catalysant l'émergence de la prochaine génération de chercheurs interdisciplinaires dans le domaine des maladies infectieuses à travers le pays, tout en consolidant les interactions entre la recherche publique, les agences de santé et les décideurs autour de l'anticipation d'une pandémie de virus respiratoire encore indéterminée, ce projet vise à contribuer, scientifiquement et au-delà, à la préparation du pays à de futures épidémies et crises sanitaires.